全國人大常委會委員、民進中央人口資源環境委員會主任王毅認為，應逐步建立長江流域綜合管理相關方面的協調機制、明晰流域綜合管理相關方面的管理職責。

　　調研組認為，應當建立明晰的水權配置和交易機制，確定區域取用水總量和權益，確認取用水戶的水資源使用權，開展水資源使用權確立登記，完善水資源有償使用制度，建立國家、流域、區域各層面的水權交易平臺，建立健全水權配置體系和水權交易制度。同時，建立符合市場導向的水價形成機制，推進水價綜合改革，合理確定農業用水和流域城鎮供水價。

　　完善管理制度，實現經濟發展和生態文明的有機統一

　　資源富集的特殊貧困地區，源源不斷的資源輸出，并未很好地帶動這些區域的經濟社會發展，諸如經濟結構失衡、產業萎縮、生態環境惡化等問題反而日益積累。金沙江下游水資源富集的特殊地區攀枝花，就是這樣一個典型。

　　攀枝花市委書記劉成鳴介紹說，攀枝花水電開發在促進了經濟社會發展的同時，對區域水生態造成一定不利影響。一方面，水生物的生存條件受到限制，另一方面，河岸陸生動植物的生存受到影響。先期開發水電項目移民搬遷安置存在的問題與生態問題相互影響，在局部有惡化的趨勢。

　　調研組調研后認為，由于社會管理方式尚不明確，公眾參與流域綜合管理的積極性還沒有充分調動，參與管理的方法、內容、深度都不成熟，同時，由于流域規劃分別由不同部門和地方政府組織編制，規劃的實施也缺乏強有力的監管手段，規劃協調性不足、權威性不夠，很難對流域治理開發與保護起到科學指導和有效約束作用。