與“十二五”規劃相比，《規劃》在明確藥品供應保障基本功能的同時，進一步強調藥品流通行業服務大健康產業、滿足人民群眾大健康需求的創新功能。為此，《規劃》提出以“建立現代藥品流通體系”為目標，以“促進行業轉型升級”為主題，以“流通信息化、標準化、集約化”為方向，以“改善行業發展環境”為著力點的總體思路。

《規劃》明確一個目標，在“十二五”期間提出“建立藥品流通體系”目標的基礎上，《規劃》明確提出“十三五”期間藥品流通行業發展的總體目標是“形成統一開放、競爭有序、網絡布局優化、組織化程度和流通效率較高、安全便利、群眾受益的現代藥品流通體系”。其關鍵在于“現代”二字，強調“十三五”期間建立藥品流通體系應包含運用現代物流和信息技術，發展藥品連鎖經營、協同物流和醫藥電子商務等現代藥品流通方式，發揮行業藥品供應鏈集成管理、大健康管理等現代服務功能，強化企業現代管理能力等內容。

《規劃》突出一個主題。遵循“創新發展”理念，突出行業轉型升級這一主題，提出以“促進行業轉型升級” 為主線。具體來看，藥品批發企業在“十二五”中后期大力兼并重組，集中度不斷提升，“十三五”期間將重點向供應鏈管理服務商轉型。藥品零售企業在“十二五”后期被資本市場看好，部分零售連鎖企業陸續上市融資，實現網點快速擴張，并逐步進軍大健康領域，“十三五”期間將重點向藥學服務和大健康管理服務商轉型。醫藥物流企業在“十二五”期間開始向醫療機構和藥品生產企業提供延伸服務，全供應鏈服務模式逐步形成，“十三五”期間將重點向上下游供應鏈緊密銜接、倉儲資源和運輸資源有效整合的現代綠色醫藥物流服務商轉型。醫藥電商企業在“十二五”后期發展迅速，并在“互聯網+藥品流通”、“互聯網+藥學服務”等多個領域不斷進行探索嘗試，“十三五”期間將重點向線上線下融合、多領域跨界融合的綜合服務商轉型。

《規劃》強調一個著力點。強調行業管理部門在“十三五”期間應著力改善藥品流通行業發展環境。

一是優化行業布局。發布區域行業信息，引導藥品流通資源有效配置。規劃布局以大型骨干企業為主體、中小型企業為配套補充的現代藥品流通網絡。

二是完善法規政策體系。健全藥品流通相關法律法規和政策措施，加快推進藥品流通領域改革。

三是完善市場機制。清理和廢止阻礙藥品流通行業健康發展的政策和規定，清除市場壁壘，打破地方保護和地區封鎖，促進形成全國統一的藥品流通市場體系。

四是規范市場秩序。發揮12312商務綜合行政執法投訴舉報熱線的作用，嚴厲打擊藥品流通市場違法違規行為，切實維護公平競爭的市場秩序。

五是加強信用建設。加強行業誠信和職業道德教育，規范企業經營行為，建立健全信息公開、分類管理、社會監督的行業信用管理機制。

《規劃》的指導思想是以提高人民健康水平為核心，以改革創新為動力，以建立現代藥品流通體系為目標，以促進行業轉型升級為主線，以流通信息化、標準化、集約化為方向，以改善行業發展環境為著力點，積極推進藥品流通行業供給側結構性改革，充分發揮其在服務醫療衛生事業與健康產業的功能作用。

總體目標是到2020年，藥品流通行業發展基本適應全面建成小康社會的總體目標和人民群眾不斷增長的健康需求，形成統一開放、競爭有序、網絡布局優化、組織化程度和流通效率較高、安全便利、群眾受益的現代藥品流通體系。

具體目標是培育形成一批網絡覆蓋全國、集約化和信息化程度較高的大型藥品流通企業。藥品批發百強企業年銷售額占藥品批發市場總額90%以上；藥品零售百強企業年銷售額占藥品零售市場總額40%以上；藥品零售連鎖率達50%以上。

《規劃》提出五項重點任務。

一是合理規劃行業布局，健全藥品流通網絡。引導藥品流通行業有效配置資源，構建遍及城鄉的藥品流通網絡，逐步提升行業集中度。

二是提升流通管理水平，打造現代醫藥供應商。優化藥品供應鏈管理，提高藥品供應鏈運作效率，發展現代綠色醫藥物流。

三是創新行業經營模式，拓展行業服務功能。推進“互聯網+藥品流通”，創新零售服務模式，培育發展中介服務。

四是“引進來”與“走出去”相結合，提升行業開放水平。進一步提升藥品流通行業利用外資質量，推動藥品流通企業開展形式多樣的國際交流與合作，參與藥品供應鏈國際分工，增強國際競爭力。

五是加強行業基礎建設，提高行業服務能力。完善行業標準體系，提升行業統計工作質量，加強理論研究和人才培養，強化企業經營管理能力。