謝明輝提出7大請辭理由，包括陸客縮減、兩岸共同打擊犯罪協議失效、蔡就職演說被評為“沒有完成的答卷”、當局無法維護南海權益、雄三飛彈釀兩岸危機、兩岸服貨貿協議卡關，以及任用深綠背景的田弘茂擔任海基會董事長。他預期兩岸關系將陷入全面停擺，海基會也無法發揮功能，因此辭去顧問一職。

謝明輝受訪表示，蔡當局政策上不承認“九二共識”，海基會董座又選擇深綠人士出任，等于在兩岸關系政策及人事兩層面上，都選擇“冰封”，并非善意展現。蔡任用田弘茂，他認為這是蔡向深綠靠攏，代表親美日遠大陸的立場明確化，兩岸正式從“冷和平”階段進入“冷對抗”時期，“外交”經貿將全面遍地烽火。

他預判，未來海基會將連最重要的服務臺商功能都喪失掉，回到陳水扁時代虛級化機構。再加上“立法院”正刪減海基會預算，業務勢必縮編，大陸臺商往后僅能自力救濟，組成臺商協會以取代海基會的功能。