二戰結束、日本無條件投降后，按照1945年《開羅會議宣言》、《波茨坦公告》以及日本《無條件投降書》的條款，南海諸島都歸還給中國。1946年10月，國民黨政府決定收復西沙、南沙群島，并派海軍艦隊進駐。委任林遵為進駐西沙、南沙的海軍艦隊指揮官，率艦艇編隊，執行接收、進駐西沙群島、南沙群島任務。

當時，因南海諸島淪陷多年，具體情況不明，只能根據有關航海圖志制定進駐方案。同時，一些外國艦艇也竄至南海海域活動，有謀劃搶先侵占各島的跡象，給籌備工作帶來一定的緊張氣氛。但在林遵等的領導下，出發前的準備工作開始緊張有序地進行。

考慮到收復南海航程遙遠，海上風浪險惡，制定航海計劃就成為關鍵的環節。何炳才是“太平”艦的少校副艦長，從1934年起就在海關航標船和測量船上工作多年，對沿海航標、航道比較了解，對在大風浪中運送人員和物資上海島也有一定經驗，因此把制定航海計劃和領航的任務交給他負責。另外，林遵對參謀戴熙愉的航海才能非常賞識，指示他與“太平”艦副艦長何炳才、參謀林煥章密切合作，共同研究擬訂航行計劃。

當時對南沙群島的航海資料和航法，不論中外航路指南均無闡述，只說這里是“危險地帶”。

當何炳才接到指揮官林遵交代領航重任時，立即四處搜羅資料，從上海海關海務處找到一張1910年關于南沙群島的舊海圖，但該圖比例尺很小，水深點也很疏。從這幅海圖中，得知南沙群島的島礁和暗沙，大部分是由珊瑚礁構成，并多為水面下的環抱著礁湖的環礁。全區沒有燈塔或任何航標。

太平島算是最大的島，面積也不到0.5平方公里，高度只有3.3米。在能見度良好的情況下，也只可在靠近7至8海里內才能看到該島。在天水相連的遼闊南海中找它，的確有大海撈針的感覺。要登上該島，還必須經過珊瑚面航行，摸索深水航道前進，能否找到這條航道，當時還缺乏有關資料。

但何炳才等人認為事在人為，既然我們的祖先能登上這些島嶼，擁有現代化設備的海軍也一定能夠登島成功。

何炳才與戴熙愉、林煥章等認真研究南沙群島的地理形勢和周圍水深及南海的氣候、風向、海流、海浪等資料，分析過去沉船多在南沙群島東北部的原因。經過半個月研究、設計和準備，制訂了全部航行計劃、途中艦隊聯系及指揮信號等，并經上級批準執行。

此外，在其他方面，林遵等人也做了充分準備：參加收復南海諸島的艦隊除了要帶上長途航行中所必需的各項生活補給及南中國海的地理、氣象資料外，還要準備派駐島上的衛戍兵力及其生活必需品，包括一個連官兵居住的活動房屋，以及計劃在島上繁殖的豬、牛、羊等牲畜和各類蔬菜種子等等，當然更少不了與大陸聯絡的通訊設備。國民政府還派遣有關部門的代表隨同林遵艦隊前往南海諸島視察和勘探，并聘請專業人員負責參與南海島嶼國界的劃定，及整理南海水域的島礁、石群及沙灘名稱的工作。

為做到有備無患，林遵還派人向漁民了解南沙和西沙群島的詳細情況。林遵利用出發前和在榆林港休整機會，向參加收復南海諸島的海軍官兵宣講帝國主義侵略南海的罪行，激發官兵為收復南海、衛國守土的激情。

在經過上述周密準備后，1946年11月至12月期間，林遵率領的艦隊最終成功登上南海諸島，向世界宣告西沙群島、南沙群島及其海域的收復與進駐任務，至此順利完成。